Iskander-M: phiên bản dành riêng cho quân đội Nga, 2 bệ phóng tên lửa trên xe bệ phóng, tầm bắn khoảng 500 km, đầu đạn nặng 700 kg.
Iskander-K: phiên bản cái tiến có sử dụng tên lửa hành trình. Tên lửa hành trình R-500 có thể đạt tầm bắn đến 2.000 km.
Iskander-E: phiên bản xuất khẩu, có tầm bắn bị cắt giảm còn 280 km, khối lượng đầu đạn bị cắt giảm còn 480 kg nhằm đáp ứng những yêu cầu về kiểm soát công nghệ chế tạo tên lửa, chống sao chép.
